Il fut nommé par l’empereur romain Tibère gouverneur d’Égypte [1] en 31 ou en 32, et ce pour une durée de 6 ans. Les premières années de son règne furent sans histoire, Flaccus administrant la région avec compétence et respect des mœurs et populations locales.
Il était proche de Tiberius Gemellus, petit-fils de Tibère, qu’il considérait comme le successeur légitime de l’empereur, fuyant le parti du futur empereur Caligula. À la mort de Tibère, en 37, c’est pourtant Caligula qui prend le pouvoir, grandement aidé par le préfet du prétoire [2] Macron. Ce changement à la tête de l’Empire marque un changement radical dans les actions et l’administration de Flaccus en Égypte.
Philon d’Alexandrie lui prête toutes sortes d’actions en défaveur de la communauté juive d’Alexandrie [3], après le passage à Alexandrie en 38 d’Hérode Agrippa 1er, fraîchement nommé roi de la tétrarchie de feu son oncle Hérode Philippe. Il est acclamé par les Juifs qui voient dans son ascension des espoirs de renouveau national juif. Cette visite entraîne de grandes émeutes qui ensanglantèrent la ville plusieurs jours durant.
Flaccus va continuer ses actions à l’encontre des Juifs, lesquels souffrirent un changement de statut, étant désormais considérés en tant qu’étrangers, leur cantonnement dans une bande étroite d’un des cinq quartiers de la ville, le pillage de leurs maisons, mais encore la profanation de leurs proseuques [4], où Flaccus fit installer, en l’honneur de Caligula à qui il cherchait à plaire, des boucliers à l’effigie de l’empereur.
Flaccus avait trempé dans la conspiration qui avait abouti à l’assassinat de Germanicus en 19, homme grandement aimé du peuple romain mais avant tout père de l’empereur Caligula. Alors que les plaintes accouraient à lui dénonçant les exactions de Flaccus en Égypte, Caligula envoya un groupe de soldats capturer le gouverneur à Alexandrie, et le fit juger.
Le jugement, ordonné par Caligula, fut l’exil à Gyaros [5], île de la mer Égée [6]. Néanmoins, après l’intervention de Lepidus, son infortune fut adoucie et on l’envoya à Andros [7], dans le voisinage de Gyaros.
Quelques mois plus tard, vers le commencement de l’année 39, une troupe de soldats débarqua à Andros, et mit à mort Flaccus.