Fils de Cléopâtre Théa et d’Antiochos VII Sidêtês, épousé et mis sur le trône par Cléopâtre après que celle-ci fut abandonnée par son premier mari, le frère d’Antiochos VII, Démétrios II Nicator.
Il entre en lutte contre son demi-frère Antiochos VIII Philométor, fils de Démétrios II et de Cléopâtre, et lui enlève la Cœlé-Syrie [1] en 114.
À la mort de son frère il gouverne l’ensemble du royaume mais entre en conflit avec un des fils d’Antiochos VIII, le futur Séleucos VI , et il fut tué par celui-ci.
Antiochos IX a eu 2 épouses. Cléopâtre IV, qui lui donne un fils Antiochos X Eusèbe qui succède à son père. Et Cléopâtre V Séléné , veuve de son demi-frère.