Fils de Manuel 1er Comnène et de Marie d’Antioche . En 1180, il épouse Agnès de France, fille de Louis VII et d’Adèle de Champagne et rebaptisée Anna.
Régente de l’Empire, Marie d’Antioche suscite contre elle le mécontentement non seulement par ses origines latines, mais aussi en nommant comme conseiller Alexis Comnène (protosébaste) , neveu de Manuel 1er et aux sympathies pro-occidentales.
En 1182, son oncle sexagénaire Andronic 1er Comnène, organise un coup d’État suite au massacre des Latins de Constantinople [1] et fait arrêter Alexis II et sa mère, avant de les faire étrangler.