Fils aîné de Peter Swybbertszdon et de Elske Sweeling, il adopta le nom de famille de sa mère. Son premier professeur de musique fut son père, organiste à la vieille église d’Amsterdam. Puis il eut comme professeur Willemszoon. Comme son père il fut organiste et commença ce travail à l’âge 15ans peu de temps après la mort de son père. Puis travailla pour la ville d’Amsterdam.
Il devient célèbre pour ses improvisations brillantes au clavecin. Il quitta Amsterdam pour donner un avis sur des réparations et des restaurations d’instruments. Sweelinck eu comme élèves Andréas Düben, Peter Hasse, Samuel et Gottfried Scheidt, Paul Siefert, Ulrich Cernitz, Jacob Praetorius, et Heinrich Scheidemann.
Il a laissé 33 chansons, 19 madrigaux, plus de 30 motets et 153 arrangements de psaume. Ses 70 travaux de clavier consistent principalement en fantasias, toccatas, et variations.
Il influença les organistes anglais, John Taureau et Peter Philips. Il décéda à Amsterdam en 1621.
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